當一個厭氧反應器需要進行生物啟動時，如果需要處理的有機負荷小于該反應器*大的處理負荷時，可以按照需處理的有機物總量核算出相應的厭氧污泥接種量，而沒有必要滿量接種，從而降低厭氧污泥的采購成本。
那么到底該接種多少厭氧污泥呢?這需要了解污泥負荷這個基本概念：污泥負荷是指每天施加給單位質量有效厭氧污泥的有機物的量，以SCOD的公斤數衡量，計算公式為：
污泥負荷：
(kgSCOD/kgVS·d)=Q(m³/d)*SCOD(mg/L)/VS(kg)
其中：
Q：厭氧反應器每日的處理量
SCOD：廢水的溶解性cod濃度
VS：厭氧反應器中厭氧污泥的揮發性固體總量
接種污泥啟動
啟動分以下三個階段進行，分別為啟動與提高污泥活性階段、形成顆粒污泥階段、逐漸形成顆粒污泥床階段：
啟動初始階段：
這一階段是指反應器負荷低于2KgCOD/(m 3 ·d)的階段。這一階段反應池負荷從0.5-1.5kgCOD/(m3·d)或污泥負荷0.05-0.1kgCOD/(kgVSS·d)開始。這一階段洗出的污泥僅限于種泥中細小的分散污泥，洗出的原因主要是水的上流速度和逐漸產生的少量沼氣。進入厭氧池消化降解廢水的混合液濃度不大于COD5000mg/L，并按要求控制進水，*低的COD負荷為1000mg/L。進液濃度不符合應進行稀釋。
進液時不要刻意嚴格控制所有工藝參數，但應特別注意乙酸濃度，應保持在1000mg/L以下。進液采用間斷沖擊形式，即每3～4小時一次，每次5-10min，之后逐步減斷間隔時間至1小時，每次進液時間逐步增長20～30min。起始階段，進水間隔時間過長時，則應每隔1小時開動泵對污泥攪拌一次，每次3～5min。
啟動第二階段：
當反應器容積負荷上升到2-5kgCOD/m 3 ·d的啟動階段。在這一階段洗出污泥量增大，其中大多為絮狀的污泥。洗出的原因是產氣和上流速度的增加引起的污泥床的膨脹。大量污泥洗出的結果是在留下的污泥中開始產生顆粒狀污泥。一般在從開始啟動到40d左右，可以在反應器底部觀察到顆粒污泥。
在這一階段污泥負荷的增加較快，這是因為污泥對手廢水的馴化過程基本完成，污泥的活性增加。這一階段末期，污泥的洗出由于顆粒污泥的形成而減少，顆粒污泥的良好沉淀性能使其保留在反應器內。這一階段里，反應器內的污泥濃度由于絮狀污泥的洗出降低到底的程度。而實際上，在反應器里對較重的顆粒污泥和分散的、絮狀的污泥進行了選擇。
啟動第三階段：
這一階段指反應器負荷超過5KgCOD/(m3·d)。在這一階段里，絮狀污泥變得迅速減少，而顆粒污泥加速形成，直到反應器內不再有絮狀污泥存在。在這一階段反應器負荷可以增加到很高，當反應器大部分被顆粒污泥充滿時，其*大負荷可以超過50KgCOD/(m3·d)。衡量能否獲進料量和縮短進料時間的化驗指標定控制發揮性脂肪酸VFA不大于500mg/L，當VFA超過500-1000mg/L，厭氧反應器呈現酸化狀態，超過1000mg/L則表明已經酸化，需立即采取措施停止進料，進行菌種馴化。一般來講第二段到第三段也需30-40d時間。
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